二甲弗林和哌甲酯的区别是药物的成分不同，而且在使用的时候，使用方法也是不一样的，所以需要遵从医生的嘱咐用药。二甲弗林一般对于呼吸抑制有很好的治疗效果，而且对于儿童遗尿症也有较好的治疗功效，但是哌甲酯属于促进中枢神经兴奋的药物，如果长期使用的话，很有可能会对药物产生依赖性。