牛黄清胃丸和牛黄上清丸的区别是牛黄清胃丸是清热解毒的一种药物，在平时具有清胃泄火以及润燥通便的作用，特别适合牙龈肿痛或者是便秘尿赤等疾病治疗效果好，牛黄上清丸具有散风止痛以及清热泻火的功效，比较适合大便干燥以及牙龈肿痛，咽喉肿痛等疾病，这两种药物的区别并不是很大。