扁平疣常规可以使用药物治疗，中药类的是辨证使用祛风、清热、止痒以及疏散风热，解毒的药物。常用的是蜂房、薏苡仁、赤石脂、蛇床子、地肤子、穿山甲、郁金。此类药物中医认为可以达到疏肝、祛风、止痒、活血、化瘀等多方面的作用。也可用西药类的药物，采用的是调节免疫功能的药物，如转因子口服液，胸腺肽肠溶片，香菇菌多糖片，以及针剂、注射剂，如卡介菌多糖核酸针、薄芝糖肽针。此类药物有调节免疫功能的药，能促进吞噬细胞发挥吞噬hpv病毒的作用。需要指出的是扁平疣建议综合治疗，除口服药物之外，还可外用药物，如干扰素凝胶、咪喹莫特软膏、5-氟尿嘧啶软膏。此外，也可使用局部的物理治疗，常用的有火针、点阵激光以及光动力治疗等。