虽然两者都是由于病毒感染引起的，而且都具有传染性，但两者还是有很大区别的，手足口病是以手足口腔为特征的一种儿童病毒性皮肤病，本病主要通过粪口途径传播，也通过飞沫经呼吸道传播，本病多见于五岁以下儿童，发病前可有不同程度的低热，头痛等前驱症状，一到三天后手足口部出现皮损，周围绕以红晕，病程一般是一周左右，预后极少复发。而水痘是由水痘-带状疱疹病毒引起的原发性感染，具有很强的传染性，在冬春季节发生，通过飞沫经呼吸道或直接接触疱液而传染，发病前可有发热，头痛等前驱症状，很快全身发展，一般先从躯干部开始，逐渐向头颈部及四肢扩散，典型皮损为散在和密集分布绿豆和黄豆大小的圆形水疱疱疹，一般病程在两周左右，这就是两者的区别。