光动力疗法是目前治疗尖锐湿疣最有效的方法，尤其对特殊部位的尖锐湿疣，如男性的尿道口、肛周；女性的前庭、阴蒂、尿道口、宫颈、阴道及肛周等部位的尖锐湿疣，对于常规治疗仍然反复发作的尖锐湿疣，可以明显降低复发率。尖锐湿疣容易复发的因素，主要是有亚临床感染和潜伏感染，光动力疗法是通过光敏剂5-阿尔法酮戊二酸与疣体及周围亚临床感染和潜伏感染的病灶靶向结合，在红光或蓝光的作用下，形成单线态氧或者其他自由基，导致病灶组织细胞的崩解和凋亡。其他常规治疗方法，如激光、冷冻、电凝以及外用药物，只能清除可见的疣体，所以光动力疗法优于其它常规方法。