长期服用抗生素有一定危害，表现为以下四个方面的损伤：第一，损伤肝肾功能和听力，通常抗生素在肝脏代谢，容易损伤肝脏功能，也容易导致肾脏损害，因为很多抗菌药物是在肾脏中排泄的。第二，容易引起神经系统毒性反应，比如氨基糖苷类损害脑神经，有耳毒性，或肾毒性，大剂量的青霉素可引起神经肌肉阻滞，呼吸抑制，氯霉素可引起精神病反应等。第三，造血系统毒性反应，比如氯霉素、链霉素，有时可引起粒细胞缺乏，头孢菌素类药物，偶尔可导致红细胞、白细胞或血小板减少。第四，容易引发并发症，因为人体内的细菌主要存在于肠道内，皮肤内、口咽部，咽炎，口腔溃疡患者长期服用抗生素，容易导致寄生菌变为致病菌并产生耐药性，当体内菌群失调，一旦有身体某部位感染，就容易恶化引发并发症，甚至危及生命。