临床上肝脓肿分为细菌性的肝脓肿和阿米巴性肝脓肿，两者的治疗方法上有不同的地方，一般来说细菌性肝脓肿是一种严重性的疾病，必须早期的诊断积极的治疗，给予患者充分的营养，纠正水电解质平衡紊乱。必要的时候可以少次多量的，输出一些全血或者血浆纠正患者的低蛋白血症，增强肌体的抵抗力，要使用大剂量的抗生素进行治疗，一般选用对革兰阴性杆菌有效的抗生素，还要注意要做细菌培养加药敏实验。然后根据实验的结果选用合理的抗生素，另外患者如果脓肿较大的话，可以经皮肝穿刺脓肿置管引流术或者开腹进行肝脓肿切开引流术，或者进行腹腔镜下肝脓肿切开引流术。另外阿米巴性肝脓肿的治疗，也可以选择经皮肝穿刺置管引流术，但是在治疗的同时要给患者抗阿米巴治疗。