治疗甲状腺功能亢进症的药物，并不是激素，常用的抗甲状腺药物，有硫脲类的丙硫氧嘧啶，以及咪唑类的甲巯咪唑，这两种药物作用机制基本上类似，都是抑制甲状腺激素的合成。抗甲状腺药物治疗应用非常广泛，治愈率能达到一半，缺点也比较多，主要的缺点就是疗程比较长，一般需要治疗1-2年的时间，有的患者甚至长达数年之久。停用抗甲状腺药物以后，甲亢的复发率也比较高，并且容易存在原发性或者继发性失败的可能，抗甲状腺药物有时也会出现肝损害和粒细胞减少症等并发症。但是药物治疗也有优点，比如疗效比较确切，不会导致永久性的甲减，药物治疗比较方便，比较便宜，使用相对来说比较安全。