第一个，是腹泻，左旋肉碱在人体的肝脏和肾脏中产生，并储存在心、脑、肌肉等处，左旋肉碱需要靠肾脏平衡并于肾脏高度储存，肝肾功能较弱的人服用左旋肉碱往往会出现不良反应，甚至出现病变，而过多服用左旋可能出现腹泻的情况。第二个，是影响睡眠，左旋肉碱燃烧脂肪，提供能量也同样会使人兴奋，如同咖啡一样有抗疲劳的功效，所以服用左旋肉碱往往可能导致失眠，影响睡眠质量。第三个，是营养不良，在服用左旋肉碱的过程当中，往往对能量的需求较少，食欲降低，而左旋肉碱减肥本身需要配合碳水化合物，以加强体能，增强体内脂肪的代谢能力，如果长期服用左旋肉碱，高消耗低摄入会造成营养不良，而使身体机能下降。第四个，左旋肉碱本身是一种安全无毒的物质，但是用来减肥的工业生产的左旋肉碱纯度往往令人质疑，往往还有一定量的地肉碱，地肉碱不但没有减肥作用，还会对肌肉产生危害，造成肌肉无力肌肉萎缩等情况。