胱抑素C是反映肾小球滤过功能的可靠指标，胱抑素C浓度几乎不受蛋白质，肌酸，饮食，身高，体重，年龄等因素影响，所以干扰因素比较少一些。胱抑素C和肾小球滤过率呈线性相关，反应肾小球功能损伤的时候敏感性比较高，显著优于血尿素氮，血肌酐和内生肌酐清除率测定，可以作为肾小球滤过功能的首选的指标。它的临床应用，主要是用来计算和估计肾小球滤过率的，而且不受病人种族差异的影响。评估一次肾脏疾病病人的肾功能还有监测肾病病人的治疗反应。胱抑素C和肾小球滤过率呈负相关，也就是说胱抑素C升高表明肾小球滤过率降低的。胱抑素C评估肥胖，老年人和营养不良病人的肾小球滤过率比肌酐测定更准确，胱抑素C增高是见于肾小球滤过功能受损，糖尿病肾病，高血压肾病以及其他肾小球早期损伤以及肾移植后有排斥反应的时候，所以说胱抑素C还是反应肾功能比较好的一个指标的。