地衣芽孢杆菌活菌胶囊主要用于细菌或者真菌引起的急慢性的肠炎，腹泻。也可用于其他原因引起的胃肠道菌群失调的防治，它能够促使机体产生抗菌活性物质杀灭致病菌，此外还能通过夺氧生物效应使肠道缺氧，利于大量厌氧菌的生长。口服的时候，成人一次是两粒，儿童一次一粒，一般都是一天三次，注意首次服用的时候剂量要加倍。吞咽困难者服用的时候打开胶囊将药粉加入少量低于四十度的温开水或者奶液混合后服用。如果与抗菌药物合用，应该间隔三个小时服用，以免降低药物的疗效。因为地衣芽孢杆菌活菌胶囊是活菌制剂，保存的时候注意不要放在高温的地方，应置于低于二十度的地方存放。