奥美拉唑肠溶胶囊主要是用于胃溃疡、十二指肠溃疡、应激性溃疡、反流性食管炎，在常规用法用量下副作用一般不多见。但是有些人群也会出现一些副作用，其中最常见的就是消化系统方面的表现有轻度的恶心、呕吐、腹胀、口干，便秘、腹痛、腹泻。再就是导致谷丙转氨酶、谷草转氨酶升高，胆红素水平的升高，这种升高一般都是轻微短暂的一般不需要治疗。有可能会引起患者出现萎缩性胃炎的改变，这种情况比较罕见。另外就是有可能会导致神经系统方面的问题，会出现感觉异常，头晕，头痛，失眠，外周神经炎。还可以导致代谢方面的问题导致维生素b12缺乏，另外有可能会引发皮疹，男性乳房发育，严重的有可能会引起溶血性贫血。