服用过量的左旋肉碱会导致轻度的腹泻。在一般左旋肉碱的减肥产品中，初次服用后，有部分人会出现轻微的头晕、口渴，还有会出现心跳加速、心慌、头晕等症状。另外左旋肉碱不可以与大量的氨基酸同时服用，因为氨基酸有抑制左旋肉碱的吸收，能令左旋肉碱发挥不了应有的作用。同时，左旋肉碱还有兴奋的作用，如果在夜晚服用的话会引起失眠。左旋肉碱服用量越大出现的不适就越多。研究显示，补充左旋肉碱每天五到十克就足够了，并不是补充得越多减肥效果越好。如果长期从外面射入左旋肉碱的话，会影响自身左旋肉碱的合成，进而影响身体的状况，会出现多种不适。