没有哪个比较好的区别,两个各有各的优点,互相补充。核磁共振能敏感地检查出组织成分中水含量的变化,显示功能和新陈代谢过程等生理生化信息的变化,它能使机体组织从单纯的解剖显像发展为解剖学与组织生化和物理学特性变化相结合的化学性图像,为先早期病变提供了诊断依据,常能比ct能更有效更早的发现病变他能非常清晰的显示脑和脊髓的灰质和白质,故在在神经系统疾病的方面诊断优于ct,对颅脑脊柱和脊髓疾病的显示优于ct,这是ct所无法比拟的。核磁共振也存在不足之处,与ct相比主要不足之处包括成像时间较长,当然全身成像十五个断层面,需要十三分钟,空间分辨率低仅为2毫米,活动时分辨率更低,故诊断心脏等活动系器官效果较差,显示骨组织的能力比ct要差,在观察颈椎骨刺韧带钙化使及椎管狭窄等骨组织的退变情况时不如ct清楚,但在显示这些骨组织退变后的改变,对脊髓神经压迫方便优于ct。