肾穿刺是一项有创的临床操作，它常见的并发症包括1.血尿镜下血尿的发生率几乎为百分之百，多数1-2天内自行消失。除非患者肾穿刺前即存在肉眼血尿，肾活检后出现的肉眼血尿多数在数日内可自行消失。如果尿的颜色较深，甚至接近鲜血的颜色，或者尿中含有血块，意味着肾脏的损伤较大，随时有血压下降的可能。在充分输血，输液仍不能维持血压稳定时应立即行外科手术治疗，也可以选择肾动脉造影，找到出血部位行动脉栓塞治疗，部分血尿患者可以发生肾动静脉内瘘。2.肾周血肿：多数为无症状的小血肿，可以自行吸收。较大的血肿应严格限制患者的活动，必要时输血，输液稳定血压。3.其他的并发症包括感染，误穿其他脏器等并发症。现在随着肾穿刺技术的进步，这些并发症已经很少见。