生殖器孢疹治疗方法主要有以下几点：第一，一般治疗，第一步主要是保持局部清洁干燥，可每天用等渗生理盐水清洗，疼痛者可口服止痛药，给予精神安慰。第二步并发细菌感染者外用抗生素药膏。第三步局部疼痛明显者，可外用5%盐酸利多卡因软膏和口服止痛药。第四步心理支持，说明疾病的性质，复发的原因和如何治疗及处理，增强与疾病斗争的信心。第二，药物治疗，可以使用抗病毒药进行治疗，采用药物阿昔洛韦和伐昔洛韦，如果是初发生殖器疱疹，疗程为七到十天，复发性生殖器疱疹疗程为五天，频繁复发者则需要较低的剂量服用较长的疗程。第三，日常护理，第一步预防感染，可每天用清水清洗生殖部位，当局部出现感染后，及时用消毒水清洗局部，常用的消毒水有3%的硼酸溶液，也可用一片黄连素研末后加入200%的沸开水，待水温后清洗患部;第二步，避免局部瘙抓，在骚扰程度可以忍受时，不要刻意去抓肉，如实在难忍时，可将手清洗，轻轻摩擦瘙痒部位，切勿使劲抓挠。