如果巧克力囊肿这种疾病还不算太严重的话，可以不用手术治疗，通过药物治疗方法也很不错，除了西医有很多治疗的药物之外，现在中药治疗这种疾病也有不错的方法了。
一、可采用药物或（和）手术治疗（保守性或根治性）。迄今为止，除根治性手术外，尚无一种理想的根治方法。无论是药物治疗抑或保守性乎术均有相当高的复发率。因此，应根据患者年龄、症状、体征、病变范围以及对生育要求等加以选择，强调个体化治疗。症状轻或无症状的轻微病变选用期待治疗；有生育要求的轻度患者明确诊断后先行药物治疗，病情重者行保留生育功能手术；年轻无生育要求的重症患者可行保留卵巢功能手术，并辅以药物治疗；症状及病变均严重的无生育要求患者可行根治性手术。
二、卵巢巧克力囊肿的药物治疗效果差，难以消除巧克力囊肿，当囊肿增大到3厘米以上，自发破裂的风险开始出现，并逐渐增加，它长到一定大小，自发破裂常难以避免。因此，它的确是藏在盆腔内的“炸弹”，说不定何时会发生“爆炸”。
三、巧克力囊肿吃什么药？
处方1：方组：黄茋、丹参各30克，苡仁、昆布、海藻各15克，当归12克，茯苓、青皮、郁金、香附、桃仁、赤芍、丝瓜络各10克。用法：每日1剂，日服2次，疗效：1个月为1疗程。
处方2：方组：桃仁3克，桂枝10克，大黄16克，芒硝10克，甘草6克，水蛭10克。用法：水煎服，每日1剂，日服2次。疗效：服药1-2疗程。
巧克力囊肿患者吃药最好是在指导下服用，临床上也有很多患者吃了不少药但没有起到理想的治疗效果，这与药物不对症、不对因有很大关系。在此建议巧克力囊肿患者用药一定要听取专家建议，并且用药过程中也与专家沟通，随时修改用药方案，这对自己的病情都是十分有帮助的。
一、可采用药物或（和）手术治疗（保守性或根治性）。迄今为止，除根治性手术外，尚无一种理想的根治方法。无论是药物治疗抑或保守性乎术均有相当高的复发率。因此，应根据患者年龄、症状、体征、病变范围以及对生育要求等加以选择，强调个体化治疗。症状轻或无症状的轻微病变选用期待治疗；有生育要求的轻度患者明确诊断后先行药物治疗，病情重者行保留生育功能手术；年轻无生育要求的重症患者可行保留卵巢功能手术，并辅以药物治疗；症状及病变均严重的无生育要求患者可行根治性手术。
二、卵巢巧克力囊肿的药物治疗效果差，难以消除巧克力囊肿，当囊肿增大到3厘米以上，自发破裂的风险开始出现，并逐渐增加，它长到一定大小，自发破裂常难以避免。因此，它的确是藏在盆腔内的“炸弹”，说不定何时会发生“爆炸”。
三、巧克力囊肿吃什么药？
处方1：方组：黄茋、丹参各30克，苡仁、昆布、海藻各15克，当归12克，茯苓、青皮、郁金、香附、桃仁、赤芍、丝瓜络各10克。用法：每日1剂，日服2次，疗效：1个月为1疗程。
处方2：方组：桃仁3克，桂枝10克，大黄16克，芒硝10克，甘草6克，水蛭10克。用法：水煎服，每日1剂，日服2次。疗效：服药1-2疗程。
巧克力囊肿患者吃药最好是在指导下服用，临床上也有很多患者吃了不少药但没有起到理想的治疗效果，这与药物不对症、不对因有很大关系。在此建议巧克力囊肿患者用药一定要听取专家建议，并且用药过程中也与专家沟通，随时修改用药方案，这对自己的病情都是十分有帮助的。