女性在怀孕期间需要进行很多次的孕检，以便来确认胎儿的发育状况保证母体和胎儿二者的安全，有些在进行检查的时候不幸的会发现一些病症，像是胎儿的食道锁闭无法进行营养物质的补充等。像是胎儿的食道闭锁的问题其实比较的严重，因为胎儿的食道很大程度上关乎他健康甚至是是否可以继续发育。
1、基因遗传
基因遗传尚未完全证实，但部分临床资料提示，食管闭锁患儿的后代可有同样的畸形。临床上已有多篇关于在食管闭锁病例中发现染色体异常的文献报道，这可能是食管闭锁基因。食管闭锁中双胎的发生率约为6%，而普通人群中双胎的发生率约1%。食管闭锁患儿中，约6.6%有染色体异常，主要包括18三体综合征。
2、环境致畸因子
环境致畸因子可能与其发生有关，与母亲长期服用避孕药或在孕期服用雌激素或雄激素有关。还有报道，食管闭锁可在糖尿病母亲的患儿或服用反应停（沙利度胺）母亲的患儿中发生。
3、细胞与细胞间物质迁移
食管闭锁中可能也存在着细胞与细胞间物质迁移等问题。从分子水平上说，shh基因可以影响脊椎动物器官的纵向发育，对原肠的发育和分化起着必不可少的作用。
临床上通常对食管闭锁采用的病理分型是Gross5型分类方法，I型：食管上下端均闭锁，食管与气管间无瘘管，约占6%；Ⅱ型：食管上端与气管之间形成瘘管下端闭锁，约占2%；Ⅲ型（临床最常见）：食管上端闭锁，下端与气管相通形成瘘管，约占85%，对于食管两端盲端间距离大于2cm为Ⅲa型，距离小于2cm为Ⅲb型；Ⅳ型：食管上下端均与气管相通形成瘘管，约占1%；Ⅴ型：食管无闭锁，仅有气管、食管瘘，形成H型瘘管，约占6%。
1、基因遗传
基因遗传尚未完全证实，但部分临床资料提示，食管闭锁患儿的后代可有同样的畸形。临床上已有多篇关于在食管闭锁病例中发现染色体异常的文献报道，这可能是食管闭锁基因。食管闭锁中双胎的发生率约为6%，而普通人群中双胎的发生率约1%。食管闭锁患儿中，约6.6%有染色体异常，主要包括18三体综合征。
2、环境致畸因子
环境致畸因子可能与其发生有关，与母亲长期服用避孕药或在孕期服用雌激素或雄激素有关。还有报道，食管闭锁可在糖尿病母亲的患儿或服用反应停（沙利度胺）母亲的患儿中发生。
3、细胞与细胞间物质迁移
食管闭锁中可能也存在着细胞与细胞间物质迁移等问题。从分子水平上说，shh基因可以影响脊椎动物器官的纵向发育，对原肠的发育和分化起着必不可少的作用。
临床上通常对食管闭锁采用的病理分型是Gross5型分类方法，I型：食管上下端均闭锁，食管与气管间无瘘管，约占6%；Ⅱ型：食管上端与气管之间形成瘘管下端闭锁，约占2%；Ⅲ型（临床最常见）：食管上端闭锁，下端与气管相通形成瘘管，约占85%，对于食管两端盲端间距离大于2cm为Ⅲa型，距离小于2cm为Ⅲb型；Ⅳ型：食管上下端均与气管相通形成瘘管，约占1%；Ⅴ型：食管无闭锁，仅有气管、食管瘘，形成H型瘘管，约占6%。